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Eine weit verbreitete Programmierumgebung für statistische Berechnungen und Grafiken.


Versionen

Aktuell haben wir auf dem Cluster Version 3.6.1 als neueste Version von R installiert. Aus Gründen der Kompatibilität werden jedoch auch ältere Versionen (siehe rechte Spalte) angeboten.

Alle Versionen wurden mit dem Intel Compiler aus dem Intel® Parallel Studio XE übersetzt und sind gegen die Intel MKL gelinkt.

Latest Information

Currently we have a mirror for CRAN to allow you to install packages without direct internet access. Please use http://cran.repo.test.hhu.de/ as mirror on Hilbert


Zusatzpakete

Eine Liste aller Zusatzpakete innerhalb von R erhält man mit:

Liste aller Pakete in R
ip <- as.data.frame(installed.packages()[,c(1,3:4)])
rownames(ip) <- NULL
ip <- ip[is.na(ip$Priority),1:2,drop=FALSE]
print(ip, row.names=FALSE)


In der aktuellen Version sind folgende Zusatzpakete vorhanden (Stand 14.05.2019):


PaketVersion
assertthat0.2.1
BH1.69.0-1
bigmemory4.5.33
bigmemory.sri0.1.3
bit1.1-14
cli1.1.0
coda0.19-2
colorspace1.4-1
crayon1.3.4
deSolve1.21
doParallel1.0.14
foreach1.4.4
glue1.3.1
iterators1.0.10
lazyeval0.2.2
magrittr15
plyr1.8.4
Rcpp1.0.1
reshape0.8.8
reshape21.4.3
stringi1.4.3
stringr1.4.0
SuppDists1.1-9.4
whisker0.3-2


Eigene Pakete hinzufügen

R ermöglicht es, eigene bzw. zusätzliche Pakete in das Home-Verzeichnis zu installieren. Dazu muss zunächst von CRAN das gewünschte Source-Paket (im tar.gz-Format) herunterladen werden. Danach kann dies, z. B. in einem interaktiven Job, wie folgt installiert werden:

  1. R-Modul laden

    module load R/3.6.1
  2. Verzeichnis(se) für weitere Pakete anlegen (falls noch nicht geschehen)

    mkdir -p ~/R/libs
  3. diesen neuen Pfad für R bekannt machen

    echo 'R_LIBS_USER="~/R/libs"' >> $HOME/.Renviron
  4. neues Paket (als Beispiel mypackage.tar.gz) in diesen Pfad installieren

    R CMD INSTALL -l ~/R/libs/ mypackage.tar.gz

Sollen weitere Pakete installiert werden, dann erübrigen sich die ersten Schritte (insbesondere 2. und 3.).

verfügbare Versionen
3.0.2
3.2.3
3.3.2

3.5.3

3.6.1