Versionen im Vergleich
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Image ModifiedEine weit verbreitete Programmierumgebung für statistische Berechnungen und Grafiken.
Inhalt type flat
Versionen
Aktuell ist Version 3.5.3
...
. Aus Gründen der Kompatibilität werden auf dem Cluster auch
...
ältere Versionen (siehe rechte Spalte) angeboten.
Alle Versionen sind mit dem Intel® Parallel Studio XE übersetzt und gegen die Intel MKL gelinkt.
Zusatzpakete
Eine Liste aller Zusatzpakete innerhalb von R erhält man mit:
| Codeblock | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
ip <- as.data.frame(installed.packages()[,c(1,3:4)])
rownames(ip) <- NULL
ip <- ip[is.na(ip$Priority),1:2,drop=FALSE]
print(ip, row.names=FALSE) |
In der aktuellen Version sind folgende Zusatzpakete vorhanden (Stand 24.05.2018):
| Name | Version |
|---|---|
| base | 3.3.2 |
| assertthat | 0.2.0 |
| BH | 1.65.0-1 |
| bigmemory | 4.5.33 |
| bigmemory.sri | 0.1.3 |
| BiocInstaller | 1.24.0 |
| bit | 1.1-12 |
| Brobdingnag | 1.2-4 |
| cli | 1.0.0 |
| coda | 0.19-1 |
| colorspace | 1.3-2 |
| contfrac | 1.1-11 |
| crayon | 1.3.4 |
| curl | 3.1 |
| deSolve | 1.20 |
| dichromat | 2.0-0 |
| digest | 0.6.15 |
| doParallel | 1.0.11 |
| edgeR | 3.16.5 |
| elliptic | 1.3-7 |
| ff | 2.2-13 |
| foreach | 1.4.4 |
| ggplot2 | 2.2.1 |
| gtable | 0.2.0 |
| httr | 1.3.1 |
| hypergeo | 1.2-13 |
| iterators | 1.0.9 |
| jsonlite | 1.5 |
| labeling | 0.3 |
| lazyeval | 0.2.1 |
| limma | 3.30.13 |
| locfit | 1.5-9.1 |
| logspline | 2.1.9 |
| magrittr | 1.5 |
| mclust | 5.4 |
| memoise | 1.1.0 |
| mime | 0.5 |
| MPTinR | 1.10.3 |
| munsell | 0.4.3 |
| nloptr | 1.0.4 |
| numDeriv | 2016.8-1 |
| openssl | 1.0 |
| pillar | 1.1.0 |
| plyr | 1.8.4 |
| PopGenome | 2.2.4 |
| prabclus | 2.2-6 |
| R6 | 2.2.2 |
| RColorBrewer | 1.1-2 |
| Rcpp | 0.12.15 |
| RcppArmadillo | 0.8.300.1.0 |
| RcppEigen | 0.3.3.4.0 |
| reshape | 0.8.7 |
| reshape2 | 1.4.3 |
| rjags | 4-6 |
| rlang | 0.1.6 |
| Rmpi | 0.6-6 |
| rstudioapi | 0.7 |
| runjags | 2.0.4-2 |
| scales | 0.5.0 |
| snow | 0.4-2 |
| snowfall | 1.84-6.1 |
| stringi | 1.1.6 |
| stringr | 1.2.0 |
| SuppDists | 1.1-9.4 |
| tibble | 1.4.2 |
| TreeBUGS | 1.3.0 |
| utf8 | 1.1.3 |
| viridisLite | 0.3.0 |
| whisker | 0.3-2 |
| withr | 2.1.1 |
Eigene Pakete hinzufügen
R ermöglicht es eigene bzw. zusätzliche Pakete in das Homeverzeichnis zu installieren. Dazu müssen Sie zunächst von CRAN das Sourcepaket (.tar.gz) herunterladen und dieses danach installieren wie folgt:
R-Modul laden
Codeblock language bash module load R/3.3.2Verzeichnis für weiter Pakete anlegen
Codeblock language bash mkdir ~/R/; mkdir ~/R/libs/Pfad für R bekannt machen
Codeblock language bash echo 'R_LIBS_USER="~/R/libs"' > $HOME/.RenvironPaket installieren
Codeblock language bash R CMD INSTALL -l ~/R/libs/ mypackage.tar.gz
| verfügbare Versionen |
|---|
| 3.0.2 |
| 3.2.3 |
| 3.3.2 |
| 3.5.3 |