Auf dem Cluster steht ein speziell für unsere Architektur kompiliertes Python 2.7.5 zu Verfügung.
Python Module
Zusätzlich zu den Modulen aus den Standardpaketen sind folgende Python Module installiert:
| Python Modul | Version |
|---|---|
| acora | 1.8 |
| argparse | 1.2.1 |
| Biopython | 1.61 |
| Cython | 0.19.1 |
| fisher | 0.1.4 |
| 1.9.4 | |
| matplotlib | 1.4.3 |
| mock | 1.0.1 |
| nose | 1.3.7 |
| NumPy | 1.7.1 |
| pandas | 0.16.2 |
| pyfasta | 0.4.5 |
| pyparsing | 2.0.2 |
| pysam | 0.7.5 |
| python-dateutil | 2.4.0 |
| python-Levenshtein | 0.12.0 |
| pytz | 2015.4 |
| scikits.statsmodels | 0.3.1 |
| SciPy | 0.12.0 |
| six | 1.9.0 |
| Spanki | 0.4.2 |
| texttable | 0.8.1 |
| virtualenv | 13.1.0 |
Eine vollständige Auflistung aller verfügbaren Pakete erhält man durch
help("modules")in einem Python Script oder der Python Shell.
