Zu Entwicklungszwecken gibt es zwei getrennte Server, welche nur für Compile und Development verwendet werden dürfen. Es gibt ein Walltime-Limit von 4 Stunden und es wird empfohlen interaktive Jobs zu nutzen.
Auf den Servern sind diverse Entwicklungspakete für Standardbibliotheken und Debugger installiert.
Schritt-für-Schritt-Anleitung
Login auf dem Login-Server per ssh
ssh Kennung@hpc.rz.uni-duesseldorf.de
Interaktiven Job anfordern mit 10 Kernen, 10GB Ram und 4 Stunden Walltime
qsub -A Projekt -I -l select=1:ncpus=10:mem=10G -l walltime=3:59:00
Nach wenigen Sekunden werden Sie auf einen der Knoten verbunden.
Nun können Sie auf dem Knoten wie gewohnt Module laden und Code kompilieren
Automatischer Logout
Wenn Sie in ihren interaktiven Jobs Programme starten die möglicherweise schnell wieder beendet sind, empfiehlt es sich der Shell mitzuteilen, dass sie sich automatisch ausloggen soll um die Ressourcen vom Job wieder freizugeben.
Eine einfach Lösung dafür ist es, die Variable TMOUT zu setzen:
if [ ! -z ${PBS_JOBID+x} ]; then
TMOUT=3600
readonly TMOUT
export TMOUT
fi
Damit wird eine interaktive Session innerhalb eines Jobs nach 1 Stunde ohne Eingabe / neue Programmstarts beendet.
Bash History
Die Standard-Shell der interaktiven Session, Bash, protokolliert ausgeführte Befehle auf der Kommandozeile in der sogenannten history analog zu einem Browserverlauf. Dies kann hilfreich sein, um bereits ausgeführte Befehle wiederzuverwenden, ohne sie neu eintippen zu müssen. Durch Eingabe des Befehls history kann der gesamte gespeicherte Verlauf ausgegeben werden. Alternativ können durch Angabe eines Parameters n (history n) die letzten n Befehle angezeigt werden.
Der Verlauf kann auch dazu verwendet werden, bereits ausgeführte Befehle zu suchen und direkt in der aktuellen Eingabeaufforderung einzufügen. Dazu dient beispielsweise das Tastenkürzel Ctrl+R. Dann ändert sich der Text der Eingabeaufforderung zu (reverse-i-search) und alle
