Eine weit verbreitete Programmierumgebung für statistische Berechnungen und Grafiken.
Versionen
Aktuell ist Version 3.3.2. Aus Gründen der Kompatibilität werden auf dem Cluster auch 3.0.2 und 3.2.3 angeboten.
Alle Versionen sind mit dem Intel® Parallel Studio XE übersetzt und gegen die Intel MKL gelinkt.
Zusatzpakete
In der aktuellen Version sind folgende Zusatzpakete vorhanden:
| Name | Version |
|---|---|
| base | 3.3.2 |
| BH | 1.62.0-1 |
| bigmemory | 4.5.19 |
| bigmemory.sri | 0.1.3 |
| bit | 1.1-12 |
| boot | 1.3-18 |
| Brobdingnag | 1.2-4 |
| class | 7.3-14 |
| cluster | 2.0.5 |
| coda | 0.19-1 |
| codetools | 0.2-15 |
| compiler | 3.3.2 |
| contfrac | 1.1-11 |
| curl | 2.8.1 |
| datasets | 3.3.2 |
| deSolve | 1.20 |
| digest | 0.6.12 |
| elliptic | 1.3-7 |
| ff | 2.2-13 |
| foreign | 0.8-67 |
| graphics | 3.3.2 |
| grDevices | 3.3.2 |
| grid | 3.3.2 |
| httr | 1.3.1 |
| hypergeo | 1.2-13 |
| jsonlite | 1.5 |
| KernSmooth | 2.23-15 |
| lattice | 0.20-34 |
| MASS | 7.3-45 |
| Matrix | 1.2-7.1 |
| mclust | 5.2.1 |
| memoise | 1.1.0 |
| methods | 3.3.2 |
| mgcv | 1.8-15 |
| mime | 0.5 |
| MPTinR | 1.10.3 |
| nlme | 3.1-128 |
| nnet | 7.3-12 |
| numDeriv | 2016.8-1 |
| openssl | 0.9.6 |
| parallel | 3.3.2 |
| plyr | 1.8.4 |
| PopGenome | 2.2.4 |
| prabclus | 2.2-6 |
| R6 | 2.2.2 |
| Rcpp | 0.12.8 |
| RcppArmadillo | 0.7.960.1.2 |
| RcppEigen | 0.3.3.3.0 |
| rjags | 4-6 |
| Rmpi | 0.6-6 |
| rpart | 4.1-10 |
| rstudioapi | 0.6 |
| runjags | 2.0.4-2 |
| spatial | 7.3-11 |
| splines | 3.3.2 |
| stats | 3.3.2 |
| stats4 | 3.3.2 |
| SuppDists | 1.1-9.4 |
| survival | 2.39-5 |
| tcltk | 3.3.2 |
| tools | 3.3.2 |
| TreeBUGS | 1.1.1 |
| utils | 3.3.2 |
| whisker | 0.3-2 |
| withr | 2.0.0 |
Eigene Pakete hinzufügen
R ermöglicht es eigene bzw. zusätzliche Pakete in das Homeverzeichnis zu installieren. Dazu müssen Sie zunächst von CRAN das Sourcepaket (.tar.gz) herunterladen und dieses danach installieren wie folgt:
R-Modul laden
module load R/3.3.2
Verzeichnis für weiter Pakete anlegen
mkdir ~/R/; mkdir ~/R/libs/
Pfad für R bekannt machen
echo 'R_LIBS_USER="~/R/library"' > $HOME/.Renviron
Paket installieren
R CMD INSTALL -l ~/R/libs/ mypackage.tar.gz
